Das Institut für Mikrobiologie beherbergt eine bundesweit einzigartige Technologieplattform für mikrobielle Proteomics die gemeinsam von Dörte Becher und Katharina Riedel geleitet wird. Die Plattform umfasst zahlreiche Hochleistungs-Massenspektrometer zusammen mit Servern und Datenanalyse-Pipelines. Die resultierenden komplexen Datensätze werden schließlich mithilfe anspruchsvoller, in-house etablierter Analyse- und Visualisierungs-Tools ausgewertet und graphisch dargestellt. Unsere umfangreichen instrumentellen Ressourcen ermöglichen eine dedizierte und an einzelne Forschungsaufgaben angepasste Auswahl der jeweils besten massenspektrometrischen Gerätekonfiguration.

Dienstleistungen

• Hochauflösende- und Hochdurchsatz-2D-Gelelektrophorese
• Umfangreiche Gelbildanalysen mit dem Delta2D Softwarepaket
• Hochdurchsatz-Proteinspot-Verdau
• Protein-/Peptid-Identifizierung und Charakterisierung mit Hilfe der Massenspektrometrie
• Gel-freie Label-basierte und Label-freie Proteomics
• Datenanalyse & Visualisierung

Anwendungen

• Charakterisierung des Gesamtproteoms
• Erstellung von Expressionsprofilen
• Immunoproteomics
• Absolute Quantifizierung für die Systembiologie
• Identifikation von posttranslationalen Modifikationen
• Protein-Protein-Wechselwirkungen
• Metaproteomics